Publications

Ici, vous trouverez mes publications scientifiques, ainsi que des articles de vulgarisation et des projets personnels.

Publications scientifiques

Floc’hlay, Swann, Ramya Balaji, Dimitrije Stanković, Valerie M Christiaens, Carmen Bravo González-Blas, Seppe De Winter, Gert J Hulselmans, et al. 2023. “Shared Enhancer Gene Regulatory Networks Between Wound and Oncogenic Programs.” eLife 12 (May): e81173. https://doi.org/10.7554/eLife.81173.

Floc’hlay, Swann, Maria Dolores Molina, Céline Hernandez, Emmanuel Haillot, Morgane Thomas-Chollier, Thierry Lepage, and Denis Thieffry. 2020. “Deciphering and Modelling the TGF-β Signalling Interplays Specifying the Dorsal-Ventral Axis of the Sea Urchin Embryo.” Development, January, dev.189944. https://doi.org/10.1242/dev.189944.

Floc’hlay, Swann, Emily S. Wong, Bingqing Zhao, Rebecca R. Viales, Morgane Thomas-Chollier, Denis Thieffry, David A. Garfield, and Eileen E. M. Furlong. 2021. “Cis-Acting Variation Is Common Across Regulatory Layers but Is Often Buffered During Embryonic Development.” Genome Research 31 (2): 211–24. https://doi.org/10.1101/gr.266338.120.

Articles de vulgarisation

Dompter son namespace avec un zest de suggest

Article de blog sur Rtask

Présenté aux Rencontres R 2024

Mentionné dans le podcast R weekly

Projets open-source

{lurex}: une application shiny pour les regex

Cette application shiny permet de construire une regex depuis un module de sélection interactive. J’ai développé cette application comme un première approche ludique des expressions régulières, souvent peut appréciées des développeurs.

Code sur GitHub

Application déployée avec ShinyLive

{millefeuille}: un package python pour les coordonnées génomiques

Ce package en cours de développment permet de manipuler des données génomiques et convertir certains formats entre eux (bed6, bed12, gff). Il est écrit en python, et possède une architecture de test unitaire complète.

Code sur GitHub